Identifikation molekularer Prognosemarker des Kolonkarzinoms im UICC Stadium II ohne Risikofaktoren mittels Next Generation Sequencing
- Die Prognose von Kolonkarzinom-Patienten im UICC Stadium II ist heterogen und bislang fehlt es an Prognosemarkern, die ein erhöhtes Rezidivrisiko identifizieren. Mithilfe von Whole- Exome-Analysen an DNA aus FFPE-Gewebe von Patienten im UICC Stadium II aus der Colopredict-Register Studie wurden die Mutationsprofile jener Patienten mit einem Rezidiv (n=3) mit jenen ohne Rezidiv (n=4) differenziell verglichen. Es gelang eine Kandidatengenliste aus 44 Genen zu erstellen, die mit einem erhöhten Rezidivrisiko assoziiert waren. Mittels Zielgen-Anreicherung gekoppelt mit der neuen, hochsensitiven Methode des Duplex-Sequencing wurden diese Kandidatengene an der größeren Patientenkohorte (n=36) resequenziert. Die Validierungsanalyse der Kandidatengene an der Gesamtkohorte zeigte eine Merkmalsauftrennung der Patientengruppe anhand der Mutationslast sowie 11 Gene, welche eine schwache Korrelation (p< 0,5) zum Rezidivstatus aufwiesen.
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| Author: | Sarah KasimirGND |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:hbz:294-105564 |
| DOI: | https://doi.org/10.13154/294-10556 |
| Referee: | Anke Claudia Reinacher-SchickORCiDGND, Stathis PhilippouGND |
| Document Type: | Doctoral Thesis |
| Language: | German |
| Date of Publication (online): | 2023/06/13 |
| Date of first Publication: | 2023/06/13 |
| Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
| Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Medizinische Fakultät |
| Date of final exam: | 2023/05/11 |
| Creating Corporation: | Medizinische Fakultät |
| GND-Keyword: | Colonkrebs; High throughput screening; Biomarker; Dickdarmkrebs; Krebsforschung |
| Institutes/Facilities: | Katholisches Klinikum Bochum, Hämatologie, Onkologie und Palliativmedizin |
| Dewey Decimal Classification: | Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / Medizin, Gesundheit |
| faculties: | Medizinische Fakultät |
| Licence (German): |  Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |
