Proteom- und Phosphoproteom-Analyse humaner Primärhepatozyten und Lebermikrosomen unter pharmakologischen Aspekten

  • Mittels 2D-DIGE\(^{TM}\) und MALDI-MS-Analyse unter Verwendung des Gel-\(\it warping\)-Algorithmus RAIN wurde untersucht, wie die Dedifferenzierung humaner Primärhepatozyten sowie die Behandlung der Zellen mit Rifampicin auf das Proteom der Zellen wirkt. Die insgesamt 20 differenziellen Proteine wurden z.T. durch mRNA-Transkriptdaten und Western-Blotting validiert. Zusätzlich wurde das Phosphoproteommuster mittels spezifischer Pro-Q® Diamond-Gelfärbung untersucht. Im Weiteren konnte gezeigt werden, wie sich nanoLC-ESI-MS/MS dazu verwenden lässt, hoch homologe Cytochrom-P450-Isoformen (CYPs) zu differenzieren und semiquantitativ zu erfassen. Zusätzlich konnten 7 neue CYP-Phosphorylierungsstellen identifiziert werden. Es wurde daraufhin eine Methode zur Quantifizierung von CYPs und CYP-Phosphorylierungen auf Basis von nanoLC-MRM entwickelt. In einem Pilotversuch konnte erstmalig die Enzymdeaktivierung von CYP2B6 durch Phosphorylierung gezeigt werden.

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Metadaten
Author:Gorden RedlichGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-23520
Referee:Katrin Marcus-AlicORCiDGND, Dirk WoltersGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:German
Date of Publication (online):2008/09/17
Date of first Publication:2008/09/17
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2008/09/05
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:Rifampicin; Dedifferenzierung; Cytochrom P-450; Phosphorylierung
Institutes/Facilities:Medizinisches Proteom-Center, Forschungsbereich Funktionelle Proteomik
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht