Rekombination und Mutation als Ursachen genetischer Diversität bei \(\textit {Campylobacter jejuni}\)
- Es wurde eine MLST-Analyse an 7 Housekeeping-Genen für eine Stammkollektion von 33 Stämmen von Campylobacter jejuni durchgeführt. Es fanden sich jeweils zwischen 9 und 15 verschiedene Allele und zwischen 1,67 - 8,13% polymorphe Nukleotidpositionen sowie 31 verschiedene Sequenztypen. Die durchschnittliche Homoplasy-Ratio betrug 0,42, der Standardized Index of Association 0,256 und es zeigten sich netzwerkartige Splitsgraphen für die meisten Gene. \(\textit {Campylobacter jejuni}\) zeigt damit eine relativ geringe Sequenzvariabilität verglichen mit der verwandten Spezies \(\it {Helicobacter pylori}\). Durch häufige Rekombination entstehen bei einer schwach klonalen Populationsstruktur allerdings aus der relativ geringen Anzahl verschiedener Allele viele unterschiedliche Sequenztypen. Die untersuchten Gene sind für die Erstellung eines MLST-Verfahrens zur Typisierung von \(\textit {Campylobacter jejuni}\) geeignet.
Author: | Marc LohrengelGND |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-9015 |
Referee: | Sören GatermannGND, Stephan HollerbachGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | German |
Date of Publication (online): | 2003/11/17 |
Date of first Publication: | 2003/11/17 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Medizinische Fakultät |
Date of final exam: | 2003/10/16 |
Creating Corporation: | Medizinische Fakultät |
GND-Keyword: | Populationsgenetik; Homoplasie; Genetische Variabilität; DNS-Sequenz / Variabilität; Morphismus |
Institutes/Facilities: | Medizinische Fakultät, Abteilung für Medizinische Mikrobiologie |
Dewey Decimal Classification: | Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften / Medizin, Gesundheit |
faculties: | Medizinische Fakultät |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |