Rev-dependent association of cellular proteins with HIV-1 genomic RNA
- Beside its nuclear export function, the HIV-1 Rev protein greatly enhances translation of viral intron-containing RNAs and the encapsidation of the genomic RNA into new viral particles, while affecting the cytoplasmic viral RNA levels only moderately. Thus, the viral unspliced RNA present in the cytoplasm is used differently in the presence and absence of Rev which might be due to a change in the Ribonucleoprotein complex composition. Therefore, I analyzed the Rev-dependent interaction of a panel of selected proteins with HIV-1 RNA by performing RNA Immunoprecipitations. In summary, these data show that the Rev-dependent export of viral genomic transcript led to a changed association of several cellular RNA-binding proteins which might contribute the effect of Rev on the utilization of this HIV-1 RNA.
- Neben der Funktion im nuklären RNA Export, steigert das HIV-1 Rev-Protein die Translation von Intron-enthaltenden viralen RNAs und die Verpackung der genomischen RNA in neue Viruspartikel, während die Mengen an zytoplasmatischer viraler RNA nur schwach beeinflusst werden. Die im Zytoplasma vorliegende virale ungespleißte RNA wird demnach in der An- und Abwesenheit von Rev unterschiedlich genutzt, was durch eine Änderung der Komposition der Ribonukleoproteinkomplexe bedingt sein könnte. Aufgrund dessen wurde die Rev-abhängige Interaktion von einer Reihe an ausgewählten Proteinen mit der HIV-1 RNA mittels RNA-Immunpräzipitationen analysiert. Zusammenfassend zeigen diese Daten, dass der Rev-abhängige Export des viralen genomischen Transkripts zu einer veränderten Assoziation von mehreren zellulären RNA-Bindeproteinen führt, welche somit zu dem durch Rev vermittelten Effekt auf die Nutzung dieser HIV-1 RNA im Zytoplasma der Zelle beitragen könnten.
Author: | Bianca HoffmannGND |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-42911 |
Referee: | Klaus Thomas ÜberlaGND, Joachim RassowORCiDGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | English |
Date of Publication (online): | 2015/02/09 |
Date of first Publication: | 2015/02/09 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie |
Date of final exam: | 2014/11/25 |
Creating Corporation: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
GND-Keyword: | HIV; Gen rev; RNS-Bindung; RNS-Bindungsproteine; RNS / Helicasen |
Institutes/Facilities: | Institut für Hygiene und Mikrobiologie |
Medizinische Fakultät, Abteilung für Molekulare und Medizinische Virologie | |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie |
faculties: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |