Umfassende Charakterisierung des Membranproteoms eines L-Lysin produzierenden \(\textit {Corynebacterium glutamicum}\) Stammes
- Das Ziel meiner Promotion war die Entwicklung einer Methode zur umfassenden Charakterisierug des Membranproteoms eines L-Lysin produzierenden \(\textit {C. glutamicum}\) Stammes. Die Detektion von Membranproteinen in Proteomstudien war bis dato stark unterrepräsentiert. Das in dieser Arbeit entwickelte SIMPLE Verfahren, ein Trypsin Vorverdau der Membranen zur Entfernung cytosolischer Proteine und ein anschließender Trypsin / Chymotrypsin-Verdau in 60 % Methanol erlaubt nun die Detektion von integralen Membranproteinen anhand von Transmembranpeptiden unter Verwedung der MudPIT-Methode. In Kombination mit der komplimentären, klassischen MudPIT-Probenvorbereitung, einer Ammoniumcarbonat-Waschung zur Entfernung cytosolischer Proteine und einem anschließenden Bromcyan / Trypsin-Verdau, konnten in dieser Arbeit insgesammt 326 integrale Membranproteine detektiert werden, was einer Abdeckrate des vorhergesagten Membranproteoms von \(\textit {C. glutamicum}\) von über 50 % entspricht.
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| Author: | Frank FischerGND |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:hbz:294-16629 |
| Referee: | Matthias RögnerGND, Eckhard HofmannORCiDGND |
| Document Type: | Doctoral Thesis |
| Language: | German |
| Date of Publication (online): | 2006/07/21 |
| Date of first Publication: | 2006/07/21 |
| Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
| Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
| Date of final exam: | 2006/06/13 |
| Creating Corporation: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
| GND-Keyword: | Elektronensprayionisations-Massenspektrometrie; Flugzeitmassenspektrometrie; Membranproteine; Proteomanalyse; Isotopenmarkierung |
| Institutes/Facilities: | Lehrstuhl für Biochemie der Pflanzen |
| Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
| faculties: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
| Licence (German): |  Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |
