Small regulatory RNAs in \(\textit {Agrobacterium tumefaciens}\)
Kleine regulatorische RNAs in \(\textit {Agrobacterium tumefaciens}\)
- \(\textit {Agrobacterium tumefaciens}\) ist ein Pflanzen-pathogenes Bakterium. Überwiegende Teile dieser Arbeit befaßten sich damit kleine regulatorische RNAs (sRNAs) in diesem Organismus zu identifizieren und zu charakterisieren. Eine bioinformatische Vorhersage für sRNAs sowie Hochdurchsatz-cDNA-Sequenzierungen (RNA-seq) lieferten zahlreiche Kandidaten. Die sRNA AbcR1 verhindert die Translation von \(\it atu2422\) und induziert die Degradation der mRNA. Das \(\it atu2422\)-Gen kodiert ein \(\gamma\)-Aminobuttersäure (GABA)-bindendes Protein. GABA ist am Abwehrmechanismus der Pflanze beteiligt. Eine Virulenz-induzierte sRNA sowie einige sRNAs, die auf dem Gegenstrang von Virulenz-Genen gefunden wurden, deuten auf einen Einfluss auf die Virulenz-Kaskade von \(\it Agrobacterium\) hin. Ein drittes Teil-Projekt war dem RNA-Chaperon Hfq gewidmet. Eine \(\it hfq\) Deletions-Mutante wies eine erhöhte Expression von ABC-Transportern, sowie signifikante Defizite im Wachstum, der Zell-Morphologie, der Motilität und der Tumor-Bildung auf.
Author: | Ina Wilms |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-32435 |
Referee: | Franz NarberhausORCiDGND, Danja SchünemannGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | English |
Date of Publication (online): | 2011/11/08 |
Date of first Publication: | 2011/11/08 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
Date of final exam: | 2011/07/01 |
Creating Corporation: | Fakultät für Biologie und Biotechnologie |
GND-Keyword: | Agrobacterium tumefaciens; Small RNA; Aminobuttersäure (gamma-); Genexpression; Ribosomale Bindungsstelle |
Institutes/Facilities: | Lehrstuhl für Biologie der Mikroorganismen |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |